خانه اعینی یکی دیگر از جاذبه‌های کیش است که کمتر به آن پرداخته می‌شود و اسم زیادی از آن برده نمی شود. این خانه یادآور خانه‌های چند خانواری و باستانی است که در گذشته بیشتر در یزد و کاشان دیده می‌شده است. وسعت خانه بسیار زیاد است و همچنین آثاری که از این خانه بدست آمده است به نظر مربوط به دوره ایلخانی است.